식물원의 서북쪽에 위치하고 있는 화훼원(花卉园)의 면적은 약 5.7헥타르이며, 초본 화초가 위주입니다. 초본 화초는 목질부가 발달하지 않는 초본경의 한 종류를 말하고, 일년생, 이년생, 다년생으로 나눌 수 있습니다.
본 원은 산세에 따라 유럽식 풍격과 캐나다 부차트(加拿大布查特) 화원의 양식을 참고해 구성하였습니다. 광활한 공터에 자연식 화경(花境)을 조성하였는데, 푸른 산봉우리, 아리따운 꽃과 교목, 서로 마주하는 두 유럽식 건물, 곧게 뻗은 측백나무 등을 배경으로 다채롭고 진기한 꽃들을 돋보이게 하였습니다. 이 곳은 사계절 꽃이 피는 각양각색의 열대, 아열대 초본 화훼의 경관을 잘 드러내주고 있습니다.